El Departamento de Microbiología desde su conformación hace 44 años ha contribuido a fortalecer el plan curricular de numerosas carreras, lo que ha permitido que nuestros universitarios accedan a los conocimientos del universo microbiológico.Actualmente el Departamento de Microbiología realiza las funciones de docencia, investigación y extensión universitaria. En las actividades de docencia el Departamento ofrece distintas materias relacionadas con las áreas de Microbiología, Inmunología, Parasitología y Micología, siendo un apoyo académico importante de múltiples carreras pertenecientes a los Centros de Ciencias Básicas, Ciencias de la Salud y Ciencias Agropecuarias, así como cursos especiales al sector público o privado. En el área de Investigación se desarrollan trabajos principalmente relacionados con la Inmunidad Innata y Adaptativa, Inmunogenética, Inmunotoxicología y Estudio de Patógenos para seres humanos y plantas. Cabe resaltar que parte del equipo de investigación tiene reconocimiento en el SNI. Como apoyo a la sociedad se realizan servicios de extensión universitaria en lo que se incluyen análisis microbiológicos clínicos y sanitarios. La misión y la visión del Departamento se fundamentan en los ejes centrales del plan de desarrollo actual de la UAA, los cuales son: Educación de calidad, Investigación Pertinente, Una vinculación efectiva y una Gestión oportuna. Un principio fundamental es la mejora contínua. Esto último mediante la acreditación de todos los programas educativos a los cuales el departamento apoya.

Desarrollar el proceso enseñanza-aprendizaje bajo los principios del modelo Educativo Institucional. Transmitiendo con profesionalismo y ética los conocimientos teóricos fundamentales y aplicaciones prácticas en las áreas relacionadas con la Microbiología, Parasitología e Inmunología. Contribuyendo precisamente a la formación profesional con la mejor calidad del estudiante en los aspectos básicos que le permitan la integración de conocimiento para materias subsecuentes o en la aplicación para actividades profesionales en el campo laboral.

Apoyar a los Programas Educativos de Pregrado y Posgrado de nuestra Institución en áreas relacionadas con la Microbiología, Parasitología, Inmunología y Micología, mediante la impartición de asignaturas de alta calidad y de pertinencia al contexto científico actual. Contribuyendo de esta forma a elevar y mantener la calidad y competitividad a nivel Estatal, Nacional e Internacional de los Programas Educativos de nuestra Institución. Desarrollar trabajo de investigación de calidad que permita la generación de conocimiento para ser difundido a nivel Nacional e Internacional y así mismo permita fortalecer los Programas Educativos mediante las tutorías de tesis y talleres de investigación, contribuyendo además a la formación de recursos humanos en las áreas científicas relacionadas con el departamento de Microbiología.

A partir de este semestre en el Departamento se tiene el Apoyo de la Tutoría de Pares por parte de estudiantes que ya cursaron las asignaturas de Microbiología, Parasitología o Inmunología.